Нехватает кальция

Здравствуйте! Моему сыну 1 год и 3 мес. на грудном вскарсливании. Родился с маленьким родничком который зарос к 8 месяцам. Целый месяц пили кальций, затем сдали общий анализ мочи на кальций. Результат отрицательный, как и месяц назад. Ребенок активный , целый день на улице гуляем, правда зубки плохо растут и ногти ломкие. Как поднять уровень кальция и какие еще существуют анализы чтобы точно знать сколько кальция в организме? Педиат говорит, что кальций плохо усваивается . Может дисбактериоз у него? Как это проявляется и можно лечить без антибиотиков?