О лечении золотистого стафилококка

Здравствуйте! У меня маленький сын (2 мес.), в полтора месяца мы сдали анализ на дисбактериоз, результат – снижено содержание бифидобактерий, выделен золотистый стафилококк 10 в 6 степени, увеличено содержание условно-патогенных бактерий р. Citobacter 10 в 8 степени. По назначению врача начала давать ему нормафлорин Л и Б, а также стафилококковый бактериофаг 5 мл в ротик и 10 мл в клизме. Ребенок находится на грудном вскармливании, раньше какал каждое кормление, после того как начали лечение какать стал реже, иногда по 12 часов не какает, а так же «стул» стал жиже, бывает что почти одна водичка. Кроме того у ребенка "спали" щечки, такое чувство что он похудел, а также бывает "вялым". Подскажите, пожалуйста, может ли это быть связано с лечением стафилококка? И как понять, не сдавая анализ, что эта болячка у нас проходит, эффективно ли лечение? Заранее благодарна!