Пневмония или внутриутробная инфекция

Добрый день, доктор!
Ситуация такая: ребенок родился доношенный 42 недели, вес 4010, рост 57, 9/9 по шкале Апгара.
Выписались из роддома с физ. желтушкой, ринит и газики были с рождения. В целом развивался хорошо.
Но к концу первого месяца так и не зажил пупок (начал мокнуть), желтушка не прошла, появились и стали усиливаться симптомы минингизма (запрокидывание головы и дрожание нижней губы), энтерит, также 4 дня держалась температура 37. По совокупности этих причин, а также с подозрением на внутриутробную инфекцию, педиатр отправил на лечение в стационар. Там обнаружили двухстороннюю очаговую пневмонию (кашля не было, тепм только 37, анализ крови: лейкоциты - 10, соэ -2 ). Лечили: цифотаксим - 7дн, виферон, смекта, глюкоза. При выписке через неделю на повторном рентгене новых очагов не было, но и старые еще не рассосались, билирубин снизился до 99 с 160, лейкоциты - 11, соэ - 2, минингизм прошел, пупок зажил, кал стал нормальный.
Все бы хорошо, но появился кашель и температура поднимается в течении дня до 37,3.
Ребенок снова стал вялым, иногда отказывается от груди, подбородок опять иногда дрожит, кал снова стал жидким со слизью.
Может это последствия болезни и так и должно быть, или ребенка не долечили?
В прошлый раз начиналось все так же, может внутриутробная инфекция, то какая? педиатр ни на какие анализы не отправляет, говорит стафилококк - пейте линекс.
Подскажите, пожалуйста, что делать, какие анализы сдать?
Спасибо.