прыщики на щёчках - обязательно аллергия?

Сыну 1,5 года.Примерно с 9 мес. на щечках появились прыщики красноватые с белой серединкой. Они его не беспокоят никак, иногда становятся поярче, иногда чуть бледнеют. Прикорм вводила с 5 мес. всё по правилам, реакции на какие-либо продукты не наблюдалось, и вдруг прыщи. Ребёнку в 11 мес. был поставлен диагноз - дисбактериоз (зол. стафилококк, недостаточное кол-во лактобактерий), сейчас лечимся уже второй раз - стафилококк не уходит. Гастроэнтеролог и дерматолог настоятельно рекомендовали соблюдать гипоаллергенную диету очень строгую, в т. ч. исключение из рациона коровьего молока и глютенсодержащих злаков. Получается очень бедный рацион, меня мучает совесть, что сын недополучит нужных ему веществ в период активного роста и развития! Скажите, действительно в нашем случае так уж необходима диета, может ли быть такое, что это и не аллергия вовсе (или не пищевая аллергия) и может нам стоит сдать пробы на аллергены? Спасибо большое.