Проблема с кишечником у ребенка

Добрый день!
Моему ребенку (мальчик) 3 месяца. Родился с весом 3100 и ростом 51, в первый месяц набрал 1100, во второй месяц 1500 и сейчас 900. Ребенок родился с помощью КС. В роддоме докармливали смесью, после роддома только ГВ. В роддоме ставили 3 дня мне антибиотики и после роддома я пила Флемоксин 7 дней (цистит).
На данный момент ребенка беспокоит живот. Стул раз в 2-3 дня, жидкий (не кашицеобразный), когда пукает пачкает подгузник, иногда достаточно сильно. В 2 месяца натужили грыжу. Сейчас сдали на дисбактериоз, лактозу и копрограмму.
http://s019.radikal.ru/i617/1203/aa/6c494a57280f.jpg
http://s019.radikal.ru/i637/1203/d8/dba00caa47cf.jpg
http://s45.radikal.ru/i107/1203/f3/1202e307ab73.jpg.
Сходили на прием к гастроэнтерологу. Назначено:
Полисорб 3 дня
Энтерофурил 2,5 1 раз в день 5 дней
Пиобактереофаг поливалентный 5 мл по 3 раза в день 7 дней
КИП 5 дней
Бифиформ Бэби 10 дней.
На данный момент Полисорб пропили, принимаем Энтерофурил 3 дня. От газов принимаем Боботик, делаем профилактику рахита 2 капли Аквадетрим, невролог назначила Пантогам (тонус и киста).
После лечения беспокойство кишечника у ребенка стало сильнее. Стул стал темно-коричневого цвета. В животе очень сильно урчит. Грудь берет с криком.
В сутки кушает примерно 8 раз (с учетом ночи).
Подскажите, пожалуйста, как облегчить боль ребенку? Стоит ли продолжать давать Энтофурил? Почему снизился набор массы?
И еще пара вопросиков: на шейке у ребенка 2 малюсеньких шарика - педиатр ничего не говорит, что это такое?
С месяцев двух стала замечать что малыш срыгивает когда я его кладу на живот, беру на руки и ношу вертикально и когда сильно надрыгает ногами(все это я делаю или до еды или через час-полтора после еды). И срыгивает он чаще всего прозрачной жидкостью с белыми комочками или створоженым молочком. ак определить что это и что с этим делать?
Извините что так много вопросов, но наш педиатр на них ответить затрудняется.
Спасибо!