Влияние амоксициллина на последующую диагностику и лечение гастродуоденита

Хочу заняться своим гастритом (пов. гастродуоденит, рефлюкс-эзофагит, картина ДЖВП по последней гастроскопии больше года назад). Сейчас - нестабильный стул (то по два-три раза в день мягкий или кашицеобразный, иногда - раз в три дня), боли на голодный желудок (обедаю около 13:00, когда прихожу с работы в пол-восьмого уже болит, проходит если поесть).
Пролечить гастрит хочу, чтобы увеличить вес (сейчас около 68кг при росте 190см), есть проблемы с кожей - много прыщей на груди/спине.
Собирался записаться на приём, но попал к хирургу из-за гидраденита 31-го мая. Вскрыли, прописали флемоксин-солютаб 1000мг 3раза в сутки на 5 дн.
Смущает, что амоксициллин используют для лечения хеликобактер. Когда мне записываться к гастроэнтерологу - можно ли сейчас или лечение амоксициллином смажет картину гастрита и схему его лечения, а как следствие лучше отложить визит к гастроэнтерологу?